Einheitlicher COVID-19-Test: Erkennung, Variantentracking & Co-Infektionen in einem Verfahren

Eine neue Art von COVID-19-Teststrategie könnte den Prozess der Fallidentifikation, des Variantentrackings und der Erkennung ko-infizierender Viren vereinfachen. Derzeit sind separate Assays und komplexe Workflows für jede dieser drei diagnostischen Verfahren involviert, wobei Analysen typischerweise in hochspezialisierten Einrichtungen durchgeführt werden. Forscher haben nun alle drei Testarten in einem einzigen Verfahren kombiniert, das Point-of-Care-Tracking von COVID-19 und den vielen entstehenden Varianten von SARS-CoV-2 ermöglichen soll.

Der Test umfasst ein tragbares, Aktentaschen-großes Mini-Labor, das die langsamen und teuren Techniken vermeidet, die für COVID-19-Screening und -Monitoring Standard sind. Der Test nutzt eine genetische Methode (Rekombinase-Polymerase-Amplifikation) und einen tragbaren Sequenzer, um virale Sequenzen schnell zu detektieren und Readouts für bis zu 96 Patientensamples gleichzeitig bereitzustellen.

Der Test wurde entwickelt, um fünf Segmente des SARS-CoV-2-Genoms zu dekodieren, die jeweils ausgewählt wurden, um das Variantentracking zu unterstützen. Die Forscher integrierten auch Assays für drei häufige Atemwegsviren, die ähnliche Symptome wie COVID-19 verursachen können.

Das Team validierte die Technik – genannt NIRVANA – mit Nasen- und Rachenabstrichen von Personen mit Verdacht auf SARS-CoV-2-Infektionen. Sie testeten auch Abwasserproben aus kommunaler Kanalisation, um zu zeigen, wie die Methode populationsweites Monitoring von SARS-CoV-2 und anderen Viren ermöglichen könnte.

Eine Einschränkung des Tests ist, dass er nur SARS-CoV-2-Mutationen in ausgewählten Genomregionen detektieren kann und da ständig neue besorgniserregende Varianten weltweit auftauchen, müssten diese Regionen möglicherweise aktualisiert werden, um die sich entwickelnde Natur des Virus widerzuspiegeln.